北：輕軌綠線最北端終點站為東劍橋的萊希米爾站，與之銜接的為劍橋市和薩莫維爾市的公交車。

南：綠線經過萊希米爾高架駛入波士頓市中心地下的特里蒙特街地鐵隧道，來到波士頓公園旁的公園街站。

西：沿著博伊爾斯頓街的地鐵隧道到肯莫爾廣場肯莫爾站。市中心及後灣這段地鐵隧道通常統稱為中央地鐵隧道。波士頓輕軌綠線B支線、C支線和D支線在肯莫爾站分開。

B支線也被稱作「波士頓學院線」（Boston College）或「聯邦大道線」（Commonwealth Avenue），是目前營運中的最北側的線，沿聯邦大道行駛，經過波士頓大學校園，終點站為波士頓學院站。

C支線也被稱作「克利夫蘭環島線」（Cleveland Circle）或「燈塔街線」（Beacon Street），從聖瑪麗街隧道出入口來到地面，沿著燈塔街行駛，終點站為布魯克萊恩的克利夫蘭環島站。

D支線也被稱作「河濱線」（Riverside）或「高地線」（Highland），沿著曾經的波士頓至奧爾巴尼鐵路高地客運線沉降軌道行駛。其市郊段全長約16.9公里，為所有支線中最長的一條。列車穿過布魯克萊恩和牛頓市，終點站為河濱站。D支線市中心方向終點站為政府中心站。

E支線也被稱作「希思街線」（Heath Street）或「亨廷頓大道線」（Huntington Avenue），在科普利站與其他支線分開，向西南方向進入亨廷頓大道地鐵隧道。列車從東北大學和波士頓交響大廳之間的隧道出入口來到地面，沿著亨廷頓大道行駛，終點站為退伍軍人醫療中心附近的希思街站。

薩默維爾及梅德福延長線（綠線延長線）

綠線延長線規劃了兩條分支，在萊希米爾站北部分叉。D支線終點站延伸至梅德福。列車經過萊希米爾站後，沿著與洛厄爾線平行的鐵軌行駛，經過東薩莫維爾站、吉爾曼廣場站、馬貢廣場站和鮑爾廣場站，到達位於梅德福塔夫茨大學旁的梅德福／塔夫茨站。

波士頓輕軌綠線E支線終點站延伸至聯合廣場站，沿著與菲奇堡線平行的鐵軌行駛，到達薩莫維爾的聯合廣場。

2021年開放的綠線延長線工程將增加6座新車站，賴希米爾站將重建成無障礙架高車站。明年確定通車，因當地人口數眾多，從前能搭大眾運輸的民眾從20%提升至現今80%，由綠線坐車至波士頓僅需10分鐘。